조세특례제한법 개정내용

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재정경제부 세제실 조세지출예산과 503-9211

<> 주요 내용

o 정부는 2002년 한·일월드컵의 성공적 개최 및 제주국제자유도시 개발

을 세제면에서 지원하기 위해 조세특례제한법 개정안을 마련하여 2월

임시국회에 제출할 계획임.

o 주요 개정내용

- FIFA가 2002년 한·일월드컵대회와 관련하여 비거주자인 경기진행요

원 및 FIFA임직원에게 지급하는 소득 등에 대해 소득세 또는 법인세

를 면제

- 제주국제자유도시 개발을 위한 세제지원

. 첨단과학기술단지, 투자진흥지구 및 자유무역지역에 입주하는 기업

에 대하여 소득세 또는 법인세를 3년간 100퍼센트, 2년간 50퍼센트

감면

. 제주첨단과학기술단지 등 입주기업이 도입하는 연구기자재 및 자본

재에 대하여 관세를 면제

. 제주도 여행객이 지정면세점에서 구입하여 제주도외의 지역으로 반

출하는 물품에 대하여는 1인당 연간 4회, 1회당 면세가격을 기준으

로 미화 300불의 범위내에서 부가가치세·특별소비세·관세 등을

면제

* 여행객은 면세점에서 물품 구입시 면세가격으로 구입하고 물품대

신 상품교환권을 받은 후, 출항시 "공항·항만" 하치장에서 상품

교환권을 물품으로 교환하여 반출

. 제주도내 골프장의 입장료에 부과되는 특소세 및 교육세를 면제

. 제주 국제선박등록특구에 등록하는 선박에 대하여 각종 지방세를

면제

- 소득세 또는 법인세의 10퍼센트 내지 30퍼센트를 감면받을 수 있는

중소기업특별세액감면 대상업종에 과학 및 기술서비스업과 전문디자

인업 등 8개 업종을 추가

- 현재 제조업등 15개 업종에 대해서만 개인사업자가 법인으로 전환시

양도소득세 이월과세를 적용토록 하고 있으나, 앞으로는 업종 제한을

원칙적으로 폐지하여 기업경영의 투명성을 제고

- 조세감면을 받은 경우에는 감면세액 상당액을 일정기간내에 차입금

상환 또는 사업용자산투자에 사용하거나 기업합리화적립금으로 적립

하여 결손보전이나 자본전입에만 사용토록 하고 있는 바, 이러한 규

제를 폐지하여 기업의 부담을 경감

- 구 조세감면규제법에 의한 자산재평가특례를 적용받아 재평가한 법인

이 주식을 2003년 12월 31일까지 한국증권거래소에 상장하지 아니하

면 재평가차액에 대한 법인세를 추징하는 바

. 한국증권업협회에 등록한 경우도 한국증권거래소에 상장한 것과 동

일하게 취급하여 법인세 추징대상에서 제외

1. 2002년 월드컵대회 관련 비거주자등의 국내원천소득에 대한 과세특례(제

104의 4, 제120조의 2)

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현행                               개정안

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<신설>                 o 월드컵과 관련하여 FIFA로부터

지급받는 다음 소득에 대하여

소득세 및 법인세 면제

- 비거주자인 경기진행요원 및

심판이 받는 수입

- 비거주자인 FIFA 임직원이 받

는 급여

- 외국축구협회가 선수파견과 관

련하여 FIFA로부터 받는 지원

금(항공료, 체재비 등)

* 국내방송사가 지급하는 방송

중계권료, 국내기업이 지급하

는 라이센스대가, 선수 및 코

치의 경기수당 등은 국내 세

법 및 조세조약에 따라 과세

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<개정이유> 월드컵대회의 성공적인 개최를 지원

<적용례> 개정법 시행후 최초로 발생하는 분부터 적용

2. 제주 국제자유도시 관련 세제지원(제6장 신설)

가. 제주첨단과학기술단지 입주기업에 대한 세제지원(제121의 8)

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현행                               개정안

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<신설>                 o 제주첨단과학기술단지 입주기업

에 대해 소득세·법인세 3년간

100%, 2년간 50% 감면

- 감면대상사업 : 생물산업, 정

보통신산업 등 대통령령이 정

하는 사업

* 지방세는 현행 지방세법에 의

해 취득세·등록세 면제, 재

산세·종토세 5년간 50% 감면

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<개정이유>

o 제주의 생물자원을 활용한 생명공학과 첨단 IT산업 등을 육성하기

위한 첨단과학기술단지의 활성화 지원

<적용례>

o 개정법 시행일이 속하는 과세연도분부터 적용

<참고> 제주첨단과학기술단지

<> 제주의 희귀한 생물자원과 청정환경을 활용한 생명공학 연구 등 교육·

연구·창업지원기능이 결합된 국가산업단지

o 위치 : 제주시 아라동

o 면적 : 446,833㎡(135,000평)

o 사업비 : 4,000∼5,000억원

o 주요 시설

- 연구시설 : 생명공학시설·농업연구시설(국책연구소 유치추진)

- 교육시설 : 외국어학교, 국제호텔경영학교 등

- 지원시설 : 창업보육센터, 상거래센터, 콜센터, 주거시설 등

<> 단지지정·개발 및 관리

o 산업단지 지정·개발은 국가산업단지 절차를 준용

- 건설교통부장관이 제주국제자유도시 추진위원회 심의를 거쳐 지정(*

개발센터는 건교부장관에게 단지지정요청 가능)

o 산업단지 관리는 제주국제자유도시 개발센터가 담당

<> 제주첨단과학기술단지에 대한 지원

o 기존 국가산업단지에 대한 지원외에 추가적인 조세감면 혜택

<현행>

- 사업시행자 : 취득세·등록세 면제, 재산세·종합토지세 50% 감면

- 입주기업 : 취득세·등록세 면제, 재산세·종합토지세 5년간 50% 감면

<추가>

- 입주기업 : 법인세·소득세 3년간 100%, 2년간 50% 감면, 연구기자재

에 대하여 관세 면제

나. 제주도내 투자진흥지구 등 입주기업에 대한 세제지원(제121의 9)

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현행                               개정안

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<신설>                 o 제주도내 투자진흥지구 및 자유

무역지역 입주기업에 대해

- 소득세·법인세 3년간 100%, 2

년간 50% 감면

* 감면대상사업(* 시행령 사항)

(투자진흥지구)

. 종합휴양업, 관광호텔업,

수상관광호텔업, 국제회의

시설업으로서 총사업비 3천

만불 이상

. 전문휴양업, 관광유람선업,

관광공연장업, 한국전통호

텔업, 종합유원시설업으로

서 총사업비 1천만불 이상

(자유무역지역)

. 제조업·물류업으로서 총사

업비 1천만불 이상

- 사업용재산의 취득·보유에 대

해 취득세 ·등록세·재산세

및 종합토지세 3년간 100%, 2

년간 50% 감면

o 투자진흥지구의 지정해제, 자유

무역지역 입주허가 취소 및 입

주기업 폐업시

- 지정해제일 등으로부터 3년간

소급하여 감면세액(소득세, 법

인세, 지방세 및 관세) 추징(*

시행령 사항)

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<개정이유>

o 제주국제자유도시의 관광사업 투자유치 및 제조·물류기반 확충을

위하여 제주도내 투자진흥지구 및 자유무역지역 입주기업에 대해

조세지원을 강화

o 입주기업이 투자금액 요건의 미충족, 사업내용의 변경등으로 입주

가 취소되거나 폐업하는 경우 감면세액을 추징하되

- 10년간 감면(7년간 100%, 3년간 50%)이 적용되는 외국인투자기업

에 대해 5년간 소급추징하는 것과의 형평을 고려하여 3년간 소급

추징

<적용례>

o 개정법 시행일이 속하는 과세연도분부터 적용. 다만, 지방세 면제

는 개정법 시행일 이후 취득하는 분부터 적용

<참고> 제주투자진흥지구

<> 제주국제자유도시의 관광사업 투자유치를 위해 내·외국인 투자에 대해

조세감면 등 인센티브를 제공하는 제도 도입

<> 지구지정

o 지정요건 : 내·외국인 투자로서 다음 요건에 해당하는 업종

- 종합휴양업, 관광호텔업, 수상관광호텔업, 국제회의시설업으로서 총

사업비 3천만불 이상

- 전문휴양업, 관광유람선업, 관광공연장업, 한국전통호텔업, 종합유원

시설업으로서 총사업비 1천만불 이상

o 지정절차

- 제주도지사가 제주국제자유도시 추진위원회 심의(실무위원회에 위임)

를 거쳐 지정

<> 제주투자진흥지구에 대한 지원

o 법인세, 소득세, 지방세를 3년간 100%, 2년간 50% 감면

o 사업에 직접 사용하기 위해 초기에 도입하는 장비·설비 등에 대해 관

세 100% 감면(개·보수용은 제외)

o 투자기업에 대해 개발부담금·농지전용부담금·산림전용부담금, 대체조

림비·대체초지조성비, 농지조성비 50% 감면

o 국·공유지 50년간 임대 및 사용료 감면

o 교육훈련, 고용·연구개발 보조금 등 지원

다. 제주첨단과학기술단지등 입주기업에 대한 관세면제(제121조의 10 및

제121조의 11)

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현행                               개정안

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<신설>                 o 다음의 수입물품에 대하여는 관

세를 면제

- 제주첨단과학기술단지 입주기

업이 연구개발에 사용하기 위

하여 수입하는 물품

- 제주투자진흥지구 입주기업이

사업에 직접 사용하기 위하여

수입하는 자본재(수리 또는 개

체용 물품은 제외)

. 외국인투자자가 투자목적으로

도입하는 물품을 제외하고는

국내제작이 곤란한 물품에 한

함.

* 자본재 : 외국인투자촉진법

에 의한 자본재

o 관세면제후 3년내 용도외 사용

또는 처분시 감면세액 추징

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<개정이유>

o "제주국제자유도시 기본계획"에서 투자진흥지구 입주기업에 대한

관세감면은 투자초기에 수입되는 물품을 대상으로 하고 있으므로

수리 또는 개체용 물품은 감면대상에서 제외

* 외국인투자촉진법 제2조 제8호의 자본재 : 산업시설(선박·차량·

항공기 등을 포함)로서의 기계·기자재·시설품·기구·부분품·

부속품 및 농업·임업·수산업의 발전에 필요한 가축·종자·수

목·어패류 기타 주무부장관이 당해 시설의 최초 시운전(시험사

업을 포함한다)에 필요하다고 인정하는 원료·예비품 및 이의 도

입에 따르는 운임·보험료와 시설을 하거나 조언을 하는 기술 또

는 용역

<적용례>

o 개정법 시행후 수입하는 분부터 적용

라. 제주도 내국인 면세점제도 도입(제121의 12)

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현행                               개정안

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<신설>                 o 면세점 운영형태 : 사전면세

- 관광객이 면세점에서 면세가격

으로 물품을 구입하고 상품교

환권을 받음.

- 출항시 "공항·항만" 하치장에

서 상품교환권과 물품을 교환

하여 외부로 반출

o 관광객의 면세물품 구입한도 →

1인당 1회에 $300 이하, 연4회

구입허용

- 세금 비중이 높은 주류는 1인

$100 이하 1병, 담배는 1인당

10갑 이하 구입 허용

* 연4회 구입 체크를 위해 전산

시스템 개발

o 면세대상 품목

- 주류, 담배, 의류, 화장품, 귀

금속, 만년필 등

- 면세점에서는 면세판매가격기

준으로 $300 이하 품목만 판매

. 인별 $300을 한도로 판매가

허용되므로 $300초과 물품은

면세적용이 곤란

* 부부 2인이 면세물품 구입시

합해서 $600짜리 물품구입은

안됨.

o 면세점이용 관광객의 범위

- 제주도외의 지역으로 출항하는

내·외국인(제주도민 포함) 모

두에게 허용

- 다만, 19세 미만 청소년은 면

세점 이용금지

o 면세점운영절차등에 관한 대통

령령 ["제주도 내국인면세점에

대한 특례규정(가칭)"] 별도 제

정

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<적용례> 개정법 시행후 최초로 구입하는 분부터 적용

<참고> 사전면세제도

o 수입한 외국물품을 과세하지 않은 상태(보세상태)로 판매하는 제도

o 절차도

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물품구매

↓

구매물품 국내도착

(공·항만)

↓

보세운송

(공·항만→판매장)

↓

상품판매 ---------------------------   상품판매

(수입·통관절차 완료)                     (교환권 교부)

↓                                      ▼

도외 반출                             판매상품 이송

(면세점→공·항만)

▼

상품인도 및 교환권 회수

(수입·통관절차 완료)

▼

도외 반출

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주) ↓ : 공·항만내 면세점 판매절차

▼ : 시내면세점 판매절차

o 사전면세시 상품인도 방안

- 공항 : 제주공항 출국장 2층 공간에 인도장 설치

- 항만 : 선내에서 직접 물품 인도

o 장단점 비교

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사전면세제도                  사후면세제도

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장점    ·환급·정산절차 불필요       ·물품관리 및 판매절차 간편

·고객만족도가 큼

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단점    ·물품관리절차 복잡           ·환급·정산비용 발생

- 보세물품관리 및 상품인도   ·물품반출 확인이 어려움

절차 필요                  ·고객만족도가 적음

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마. 제주도내 골프장에 대한 조세지원(제121의 13)

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현행                               개정안

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<신설>                 o 제주도내 회원제 골프장의 입장

료에 부과되는 조세(특소세, 교

육세, 농특세)를 면제

- 회원제 골프장에 대한 지방세

중과(취득세 5배, 종합토지세

최고 25배, 재산세 17배)를 일

반과세로 전환

. 취득세 : 10% → 2%

. 종합토지세 : 5% → 0.2%∼5%

. 재산세 : 5% → 0.3%

* 대중(public) 골프장에 대해

서는 현재도 특별소비세가

면제되고, 지방세도 중과되

지 않음.

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<개정이유>

o 제주도내 골프장이 주변국과 가격경쟁력을 확보할 수 있도록 골프

장 입장료에 대한 각종 부담금 및 특소세등 조세를 면제

※ 골프장 입장료에 부과되는 제세와 종합토지세, 부담금 등 골프장

에 부과되는 제세 등을 감면시 입장료 40∼50% 인하

- 108,000원 → 64,800∼54,000원(∇43,200∼54,000원)

* 평일 비회원기준

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감면세액  특소세  교육세  농특세  부가    체육    관광  종토세

가치세   진흥    진흥    등

기금   부가금

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43,200∼   12,000   3,600   3,600  1,920   3,000  2,000  17,080∼

54,000원                                                 27,880

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<주요국의 골프장 입장료 비교>

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일본      한국      대만    싱가포르      괌     홍콩    호주

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150$   100(50∼60)    82        78        70       68     66

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주) ( )는 인하후

<적용례>

o 개정법 시행후 입장하는 분부터 적용

바. 제주 국제선박등록특구에 대한 조세지원(제121의 14)

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현행                               개정안

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<신설>                 o 국제선박등록법에 의하여 등록

한 선박으로서 국제선박등록특

구로 지정된 항구를 선적항으로

하는 선박에 대해서는

- 취득세(2%), 재산세(0.3%), 공

동시설세(0.06%∼0.16%) 및 지

방교육세(등록세 및 재산세의

20%)를 면제

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<개정이유>

o 해외에 편의치적하고 있는 국제선박의 국내 등록을 유도하고 제주

국제선박등록특구제도의 활성화를 위해 동 특구에 등록하는 선박에

대하여는 선박의 등록 및 보유와 관련된 각종 지방세를 면제

- 선박등록과 관련된 최소한의 비용부담을 위해 등록세(1%)는 부과

<적용례>

o 개정법 시행후 등록하는 분부터 적용

<참고> 제주선박등록특구(특별법 제47조 제1항)

o 제주선박등록특구는 제주국제자유도시특별법에 의하여 해양수산부 장관이

선박등록특구로 지정하는 제주도내의 개항(제주항, 서귀포항)

o 제주선박등록특구제도는 해운산업의 국제경쟁력을 확보하고 한국선박의

해외이적을 방지하며 외국선박의 등록을 유도하기 위하여 제주선박등록특

구를 선적항으로 하는 선박에 대하여 특정한 조세면제를 부여하는 일종의

제2선적제도

3. 중소기업특별세액감면 대상업종 확대(제7조)

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현행                               개정안

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o 중소기업특별세액감면

- 대상업종 : 18개 업종            - 대상업종을 시행령에 위임 →

8개 업종 추가

. 제조업, 건설업, 도매업, 소

매업, 광업, 연구 및 개발업,     . 과학 및 기술서비스업, 영화

종자 및 묘목생산업, 축산업,       산업, 공연산업, 뉴스제공업,

엔지니어링사업, 폐기물처리        전문디자인업, 포장및충전업,

업, 폐수처리업, 어업, 의료        관광사업(카지노, 관광유흥음

업, 자동차정비업, 운수업(물       식점업, 외국인전용유흥음식

류산업 및 여객운송업), 정보       점업 제외) 및 노인복지시설

처리 및 컴퓨터운용관련업,         운영업

방송프로그램제작업

- 감면내용

. 수도권소기업 : 20%

. 지방중소기업 : 30%

※ 도소매업, 의료업 및 자동      → 관광사업 추가

차정비업은 10%

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<개정이유>

o 감면제도간 업종불균형을 해소하고 서비스업에 대한 세제상 지원을

강화

<적용례>

o 개정법 시행후 최초로 개시하는 과세연도분부터 적용

4. 법인전환시의 양도소득세 이월과세 확대(제32조)

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현행                               개정안

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o 거주자가 법인으로 전환하는 경

우 법인으로 이전되는 사업용부

동산에 대하여 양도세의 이월과

세 허용

- 감면대상 : 15개 업종            - 업종제한 폐지

* 제조업, 광업, 건설업, 축산

업, 어업, 도매업, 소매업,

물류산업, 여객운송업, 부가

통신업, 연구 및 개발업, 방

송업, 방송프로그램제작업,

엔지니어링사업, 정보처리 및

기타컴퓨터운영관련업

- 감면요건

. 동 15개 업종을 영위하는 법      . 소비성서비스업을 제외한 모

인으로 전환할 것                  든 업종으로 확대

. 사업용부동산등을 현물출자하     . (현행과 같음)

거나 포괄적 사업양수도방법

에 의하여 법인으로 전환할

것

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<개정이유>

o 법인전환을 유도하여 기업경영의 투명성을 제고하기 위해 지원대상

업종의 제한을 폐지

o 다만, 소비성서비스업으로 전환하는 경우는 지원대상에서 제외

<적용례>

o개정법 시행후 최초로 법인으로 전환하는 분부터 적용

5. 감면세액 사후관리제도 폐지(제145.146조)

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현행                               개정안

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<감면사후관리제도>                <사후관리제도 폐지>

o 일반법인

- 감면세액 상당액을 기업합리

화 적립금으로 내부유보

. 감면받은 연도의 다음연도에

적립시 20% 가산세 부과

- 적립금 미적립시 감면세액 및

이자상당가산액 추징

- 자본전입 및 이월결손금보전

외 사용금지

o 중소법인 및 개인

- 감면세액 상당액을 2년내에

차입금 상환 또는 5년내에 사

업용자산 투자에 사용

. 기한내 미사용시 감면세액

및 이자상당가산액 추징

- 중소법인의 '00년 이전 감면

분은 '01년에 감면받은 것으

로 보아 5년내에 차입금 상환

또는 고정자산 투자에 사용

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<개정이유>

o 기업합리화적립금제도 등 사후관리제도는 감면세액 상당액을 내부유

보토록 하여 생산자금으로 사용토록 유도하기 위해 도입·운영

o 그러나 기업합리화적립금의 적정적립 여부 및 부채상환이나 고정자산

투자에 사용하였는지의 여부에 대하여 과세관청과 납세자간 마찰소지

상존

- 또한, 기업자금의 사용에 대한 규제적인 요소로 지적

o 사후관리제도를 폐지하여 감면세액의 사후관리에 따른 기업의 부담을

덜어주고 과세관청과 납세자간 마찰소지를 해소

<적용례>

o 개정법 시행일이 속하는 과세연도에 감면받는 분부터 적용

6. 구 조세감면규제법상 자산재평가 특례제도 요건 완화(법률 제4285호 '90.

12.31 부칙 제23조)

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현행                               개정안

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o 구 조감법상 자산재평가특례에

관한 경과조치

- 구 조감법에 의하여 재평가한     - 한국증권업협회에 등록한 경우

법인이 재평가일로부터 대통령      도 한국증권거래소에 상장한

령이 정하는 기간이내에 한국       것과 동일하게 취급

증권거래소에 주식을 상장하는

경우 자산재평가법에 의한 재      ※ 현재 미상장법인수 : 23개

평가로 보아 법인세를 과세하         (코스닥등록법인 : 7개)

지 않음.

※ 대통령령이 정하는 기간 :

재평가일부터 2003년말까지

(령 제138조 : 2001.12.31

개정)

※ 구조감법상 재평가특례(제56

조의 2)

. 한국증권거래소에 주식을 상

장하기 위한 법인은 자산재

평가법의 규정에 불구하고

매월 1일 재평가 가능

※ 자산재평가법 규정

. 재평가일(제4조) : 각 사업

연도 개시일

. 재평가의 제한(제38조) : 재

평가한 자산을 다시 재평가

하는 경우 도매물가지수가

25% 이상 상승한 경우에 한

함.

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<개정이유>

o 공개를 위한 재평가특례제도는 기업공개를 촉진하기 위한 것으로 동

제도 도입당시에는 협회등록시장이 없었기 때문에 증권거래소 상장기

업에 대해서만 특례를 인정

o '96년 7월에 협회등록(코스닥)제도가 신설되었고, 코스닥시장등록요

건이 증권거래소 상장요건과 큰 차이가 없을 뿐 아니라

- 일반적으로 세법에서 상장주식과 협회등록 주식을 동등하게 취급